MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 1685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	GCG	2	6	70	75	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016587	CATC	2	8	83	90	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016587	CCA	2	6	530	535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016587	GGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016587	CGG	2	6	1548	1553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016587	CGG	2	6	1558	1563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016587	GCC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016587	GCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016587	CGGA	2	8	2304	2311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016587	TCAA	2	8	2330	2337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016587	GCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016587	CAAT	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016587	GCA	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016587	G	6	6	4023	4028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016587	GCCC	2	8	5980	5987	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016587	G	6	6	6024	6029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016587	CGC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016587	CGG	2	6	7342	7347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016587	TCCC	2	8	8329	8336	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_016587	GCCG	2	8	8356	8363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016587	CCG	2	6	8453	8458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016587	GCCCC	2	10	9809	9818	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_016587	CGG	2	6	10988	10993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016587	TCCC	2	8	10995	11002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016587	CGGGA	2	10	11008	11017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016587	CCG	2	6	14178	14183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016587	TCCCG	2	10	14936	14945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016587	CCCT	2	8	15055	15062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_016587	CGG	2	6	15127	15132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016587	T	6	6	15196	15201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016587	CAT	2	6	15269	15274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016587	TCC	2	6	15275	15280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016587	CCTTT	2	10	15321	15330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016587	CGA	2	6	15417	15422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016587	GGC	2	6	15455	15460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016587	G	6	6	15461	15466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016587	GCCC	2	8	17708	17715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_016587	GATG	2	8	17757	17764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016587	GCG	2	6	18938	18943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016587	TCCC	2	8	18946	18953	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016587	CGGGA	2	10	18959	18968	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016587	TC	3	6	22328	22333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016587	CCGG	2	8	22348	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016587	TCCC	2	8	23571	23578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016587	TGCCGG	2	12	23592	23603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016587	TGA	2	6	23675	23680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016587	CAC	2	6	23711	23716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016587	CA	3	6	23891	23896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016587	CCCT	2	8	26801	26808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016587	CCG	2	6	26842	26847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016587	C	6	6	26935	26940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_016587	AGG	2	6	29554	29559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016587	GAG	2	6	30859	30864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016587	TCG	2	6	30865	30870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016587	GCT	2	6	30927	30932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016587	AGC	2	6	30943	30948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016587	GGGA	2	8	30987	30994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016587	CAC	2	6	31007	31012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016587	AAG	2	6	33221	33226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016587	CAC	2	6	33287	33292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016587	TC	3	6	33320	33325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016587	AGTCAT	2	12	33746	33757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016587	CAA	2	6	33822	33827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016587	AGGC	2	8	33850	33857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016587	AGC	2	6	33896	33901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016587	AGG	2	6	34190	34195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016587	CGC	2	6	35343	35348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016587	GCC	3	9	35374	35382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016587	CTTC	2	8	36443	36450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016587	TCCG	2	8	37786	37793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016587	AGG	2	6	37795	37800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016587	GGC	2	6	39009	39014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016587	CGG	2	6	39035	39040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016587	TTTG	2	8	39178	39185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016587	GGC	2	6	39255	39260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016587	TCG	2	6	39310	39315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016587	CCGG	2	8	39340	39347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016587	CG	4	8	40441	40448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016587	CGC	2	6	40534	40539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016587	GGC	2	6	40569	40574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016587	GTCA	2	8	42684	42691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016587	CGC	2	6	42753	42758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016587	CGG	2	6	42778	42783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016587	GCT	2	6	42812	42817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016587	CCG	2	6	42834	42839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016587	GCC	2	6	43689	43694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016587	C	6	6	43766	43771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_016587	CGG	2	6	43786	43791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016587	GCCCC	2	10	43932	43941	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
90	NC_016587	CAG	2	6	44008	44013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016587	CCG	3	9	44029	44037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016587	CGGC	2	8	44066	44073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016587	CAA	2	6	45338	45343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016587	TCG	2	6	45893	45898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016587	CGA	2	6	45918	45923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016587	GAG	2	6	45967	45972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016587	GCA	2	6	46039	46044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016587	AAG	2	6	46090	46095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016587	ACA	2	6	46136	46141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016587	AAG	2	6	46184	46189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016587	TGA	2	6	46275	46280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016587	GAA	2	6	46282	46287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016587	ATCA	2	8	46308	46315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016587	ACT	2	6	46721	46726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016587	CCAG	2	8	46754	46761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016587	GAT	2	6	46853	46858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016587	CG	3	6	46922	46927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016587	AAGGAA	2	12	46943	46954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016587	GGT	2	6	46956	46961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016587	GCG	2	6	47053	47058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016587	TCT	2	6	47093	47098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016587	GAA	2	6	47103	47108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016587	CAG	2	6	47129	47134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016587	CGC	2	6	47288	47293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016587	GAC	2	6	47322	47327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016587	A	6	6	47357	47362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016587	CCG	2	6	47427	47432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016587	ATGC	2	8	47482	47489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016587	GCG	2	6	47491	47496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016587	CCG	2	6	47570	47575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016587	GCCC	2	8	47643	47650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_016587	TCTT	2	8	50180	50187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016587	CCG	2	6	50216	50221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016587	GAA	2	6	50257	50262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016587	GC	3	6	50290	50295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016587	CCG	2	6	51230	51235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016587	GCG	2	6	52298	52303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016587	TGGC	2	8	52419	52426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016587	GGC	2	6	52455	52460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016587	GAT	2	6	52815	52820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016587	ATTCG	2	10	53678	53687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016587	GGC	2	6	54731	54736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016587	CTC	2	6	54741	54746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016587	CGG	2	6	55514	55519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016587	GGA	2	6	55581	55586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016587	CGG	2	6	55596	55601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016587	TG	3	6	55673	55678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016587	CTC	2	6	57177	57182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016587	TCAGG	2	10	57188	57197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016587	AT	3	6	58289	58294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016587	CGC	2	6	59386	59391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016587	GGC	2	6	59412	59417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016587	GCC	2	6	59422	59427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016587	TCT	2	6	60870	60875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016587	GGCCC	2	10	62050	62059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_016587	CGC	2	6	62090	62095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016587	GCG	2	6	62137	62142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016587	CCG	2	6	62573	62578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_016587	CG	4	8	62577	62584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_016587	CGC	2	6	65441	65446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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155	NC_016587	GCGA	2	8	67163	67170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016587	GCA	2	6	67186	67191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_016587	CGG	2	6	68585	68590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_016587	TAA	2	6	68622	68627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016587	CAG	2	6	72427	72432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_016587	TCG	2	6	116554	116559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_016587	GCG	2	6	116703	116708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_016587	GATT	2	8	116740	116747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016587	CCTC	2	8	116751	116758	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
284	NC_016587	CGG	2	6	116764	116769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_016587	TGGG	2	8	118171	118178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016587	GC	3	6	118761	118766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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288	NC_016587	TG	3	6	119077	119082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016587	GCC	2	6	119100	119105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_016587	GAT	2	6	119203	119208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_016587	ACG	2	6	119362	119367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_016587	TGA	2	6	158840	158845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_016587	TCC	2	6	158899	158904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_016587	AT	3	6	158925	158930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_016587	GCG	2	6	158989	158994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_016587	AGC	2	6	167287	167292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_016587	GCC	2	6	174962	174967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_016587	GCC	2	6	176086	176091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_016587	CGG	2	6	178552	178557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_016587	CTG	2	6	178572	178577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_016587	CGGC	2	8	181953	181960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_016587	CCG	2	6	181976	181981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_016587	AGGC	2	8	192865	192872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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